U-CH1

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Caractéristiques générales

Âge : 56 ans
Sexe : Homme
Origine de la maladie : Sacré
État de la maladie : Récidive
Radiations antérieures : Oui
Thérapie systémique antérieure : Non
Source : Silke Bruderlein, Peter Moller
Université d'Ulm

Caractéristiques moléculaires

Morphologie cellulaire : Physalifère
Expression de TBXT : Positive ; 10x celle de U-CH2 avec surexpression mais pas d'amplification
Localisation de TBXT : Nucléaire
Expression de CD24 : Positive ; 13x celle de U-CH2
Type HLA : A2
Données de séquençage :

Données WGS, Exome et Transcriptome disponibles : données de séquençage brutes dans Cavatica (Chordoma Foundation Dataset) et données résumées dans PedcBioPortal. Contactez researchteam@chordoma.org pour toute question.
Statut de SMARCB1 : Type sauvage
Résultats de la validation : Rapport de validation

Conditions de croissance

Milieu de croissance : IMDM : RPMI-1640 (4:1) +10% FBS
Milieu de congélation : Milieu de croissance complet à 70 % additionné de 20 % de sérum bovin fœtal et de 10 % de DMSO
Conditions de culture : Température : 37°C 37°C
Atmosphère : air, 95% ; dioxyde de carbone (CO2), 5%.
Instructions de repiquage : Procédures de culture cellulaire

Publications

Caractérisé par :
  • Scheil S, Brüderlein S, Liehr T, Starke H, Herms J et al. (2001) Genome-wide analysis of sixteen chordomes by comparative genomic hybridization and cytogenetics of the first human chordoma cell line, U-CH1. Gènes Chromosomes Cancer 32 : 203-211. PubMed : 11579460.

Références supplémentaires :

  • Scheipl S, Lohberger B, Rinner B, Froehlich EV, Beham A et al. (2013) Histone deacetylase inhibitors as potential therapeutic approaches for chordome : an immunohistochemical and functional analysis. J Orthop Res 31(12):1999-2005. PubMed : 23893747.
  • Brüderlein S, Sommer J, Meltzer P, Li S, Osada T et al. (2010) Molecular Characterization of Putative Chordoma Cell Lines. Sarcome : 630129. PubMed : 21253487.
  • Duan Z, Shen J, Yang X, Yang P, Osaka E et al. (2014) Prognostic significance of miRNA-1 (miR-1) expression in patients with chordome. J Orthop Res. PubMed : 24501096.
  • Shalaby A, Presneau N, Ye H, Halai D, Berisha F, Idowu B et al. (2011) Le rôle du récepteur du facteur de croissance épidermique dans la pathogenèse du chordome : une cible thérapeutique potentielle. J Pathol 223(3):336-46. PubMed : 21171079.
  • Scheil-Bertram S, Kappler R, von Baer A, Hartwig E, Sarkar M et al. Molecular profiling of chordome. Int J Oncol 44(4):1041-55. PubMed : 24452533.
  • Xia M, Huang R, Sakamuru S, Alcorta D, Cho MH et al. (2013) Identification of repurposed small molecule drugs for chordoma therapy. Cancer Biol Ther 14(7):638-47. PubMed : 23792643.
  • Duan Z, Choy E, Nielsen GP, Rosenberg A, Iafrate J et al. (2010) Differential expression of microRNA (miRNA) in chordome reveals a role for miRNA-1 in Met expression. J Orthop Res 28(6):746-52. PubMed : 20041488.
  • Yang C, Hornicek F, Wood KB, Schwab JH, Choy E et al. (2010) Characterization and analysis of human chordoma cell lines. Colonne vertébrale 35(13):1257-64. PubMed : 20461036.
  • Presneau N, Shalaby A, Ye H, Pillay N, Halai D, Idowu B et al. (2011) Rôle du facteur de transcription T (brachyury) dans la pathogenèse du chordome sporadique : une étude génétique et fonctionnelle. J Pathol 223(3):327-35. PubMed : 21171078.